Hodnocení kvality a efektivity programů primární prevence užívání návykových látek prošlo v České republice složitým vývojem. Pozvolný vývoj preventivních programů byl v průběhu 90. let minulého století několikrát negativně narušen různými vlivy, z nichž zřejmě nejzávažnějším byla nekvalitně a nesystémově připravená koncepce primární prevence Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy pro období 1998-2000. Díky ní přestalo být rozlišováno mezi programy pro volný čas dětí a mládeže a specifickými preventivními programy. Ke zlepšení situace došlo až v letech 2002-2004, kdy na základě výsledků projektu Phare Twinning Project: Drug Policy“ mezi Českou republikou a Rakouskem začala existovat společná meziresortní pracovní skupina pro primární prevenci. V současné době je dokončen návrh standardů primárně preventivních programů a je připravován manuál dobré praxe.